Em 08 de junho de 1949 concluiu-se a incorporação da Expresso Bandeirantes Viação S.A. à VIAÇÃO COMETA S.A., ficando aquela extinta. Em 02 de outubro de 1950 também foi incorporada a Rápido Serrano Viação S.A..
Logo após a ligação São Paulo - Santos, novas linhas começaram a ser implantadas como São Paulo - Campinas, São Paulo - Jundiaí e muitas outras ligações pioneiras para o interior do Estado.
Em 08 de dezembro de 1951 foi concedida sua primeira linha interestadual, São Paulo - Rio de Janeiro, pela recém construída Rodovia Presidente Dutra.
Aos 18 de março de 1954 foi apresentada a nova frota da linha São Paulo - Rio de Janeiro composta por 30 ônibus norte-americanos GM Coach modelo PD-4104, batizados de MORUBIXABA - chefe das tribos indígenas brasileiras. Moderníssimo para a época, com design revolucionário, carroçaria de alumínio, janelas panorâmicas, vidros rayban, suspensão a ar dianteira e traseira, ar condicionado, motor diesel traseiro transversal de 6 cilindros, 2 tempos e 211 cv. Foi o ônibus de maior sucesso no Brasil nas décadas de 50, 60 e início dos anos 70.
Em maio de 1962 foi inaugurada uma nova garagem central em São Paulo, que é a sede da Companhia até hoje.
Na década de 60 a VIAÇÃO COMETA tinha cerca de 300 Mercedes-Benz, modelos Super B, Senemby e Flecha Azul sendo uma das maiores frotistas Mercedes do mundo. Em 1961 entraram na frota, e dela tomaram conta, os Scania. A VIAÇÃO COMETA S.A. tornou-se a maior frotista SCANIA do mundo, marca exclusiva da segunda metade dos anos 70 até o final de 2002. Foram utilizados o B-75, B-76, B-76 Super, B-110, BR-115 Super, BR-116, K-112, K-113 e K-124.
Em 1970 foi introduzida a suspensão a ar nacional e motor turbo, que equipavam o TURBO JUMBO.
As carroçarias de duralumínio utilizadas pela Cometa, apesar do custo mais elevado, apresentam várias vantagens. Por serem bem mais leves, poupam esforço inútil ao motor, freios e demais componentes mecânicos, diminuem o consumo de pneus e combustível, proporcionam maior aceleração, agilidade e manutenção da velocidade, têm maior durabilidade, pois não sofrem a ação da oxidação sob a forma de ferrugem, e ainda, maior elasticidade, o que minimiza os danos nos casos de colisões.
Os ônibus batizados de Papo Amarelo, Flecha de Prata, Jumbo B, Jumbo C, Jumbo G, Setebelo, Turbo Jumbo, Dinossauro e Dinossauro II foram encarroçados pela CIFERAL, que entrou em concordata em 1982.
Como a COMETA já possuía uma tecnologia avançada em carroçarias com estrutura monobloco em duralumínio, partiu para a fabricação própria, uma vez que no mercado não havia nenhum outro fornecedor de carroçarias em duralumínio.
Em maio de 1982 foi dado o início da construção da fábrica e em 16 de março de 1983 a C.M.A. - Companhia Manufatureira Auxiliar foi homologada junto ao CDI - Conselho de Desenvolvimento Industrial. Em abril de 1983 saía o primeiro ônibus fabricado em casa, o FLECHA AZUL.
Embora parecido com seu antecessor, o DINOSSAURO II, este carro tinha nova estrutura que proporcionou considerável redução de peso, nova distribuição das janelas para evitar a disposição de poltronas frente às colunas, e o mais completo painel de ônibus já fabricado no Brasil, com voltímetros, amperímetros, manômetros de óleo, ar e turbina, termômetros de água e óleo, conta-giros, horímetro, tacógrafo e diversas luzes “espia”, além de alarmes sonoros. E ainda, poltronas revestidas com um material nobre, couro legítimo.
Equipado com câmbio automático computadorizado surgiu o FLECHA AZUL AUTOMÁTICO.
Com um aumento de 10 cm na altura do veículo e câmbio mecânico, foi a vez do FLECHA AZUL II.
Com a eliminação da janela rebaixada e nova distribuição das janelas, nasceu o FLECHA AZUL III.
Com rodas de alumínio, o FLECHA AZUL IV; com um vidro na parte inferior da porta e alterações internas, o FLECHA AZUL V e VII.
Com aumento de altura, cabine fechada, ar condicionado, vidros colados e poltronas Leito, o FLECHA AZUL VI e FLECHA AZUL VI B.
Com a mesma altura dos leitos, tampa do motor fechada, câmbio confort shift ou optcruiser, o FLECHA AZUL VIII.
Rompendo com o modelo anterior, surge um ônibus com três eixos, vidros fixos, ar condicionado nos veículos convencionais, nova programação visual com um Cometa estilizado na lateral, e chassi SCANIA K-124 IB 6X2, denominado COMETA, que começou a operar na linha São Paulo - Franca em 29 de abril de 2000.